另外，各地方雖已製訂有關保（bǎo）護（hù）條例，但作（zuò）為（wéi）下位法的（de）《保護條例》不能違反上位法《防治條例》的立法精神（shén）、立法內容。不能將《防治條例》已規定的，應當對劃定前的養殖場予以補（bǔ）償的行為，視為違法行為（wéi）進行處罰。綜上所述，在禁養區劃定前已養殖多年的養殖（zhí）場，如需關閉、搬遷上訴人（rén）的養殖場，縣（xiàn）級以上人民政府應當予以補償。
    因水源（yuán）地的劃定，造（zào）成企業合（hé）法利益（yì）損害（hài），行政機關應予以補償。
    根據《水汙染防治（zhì）法》《飲用（yòng）水水源保護區（qū）汙染防治管理（lǐ）規定》的相關規定（dìng），申報並（bìng）劃（huá）定飲用水水源保護區域的行為，雖然是經過省政府批複同意（yì）才組織實施的，但其（qí）劃（huá）分目的（de）仍是為了（le）維護公共利（lì）益。作為（wéi）劃定水源保護區域實施主體的行政機關，其劃分行為即便合法，可一旦因（yīn）維護公共利（lì）益，而造成（chéng）企業利益受（shòu）有損害，也應當依法予以補（bǔ）償。
    行政機關撤銷生效行政許可的行為雖然合（hé）法，但其對企業無後續處理的（de）方案（àn）和救濟渠道，由此給企業造成損失的，也應補償。
    有很多企業在建廠之初為了滿足環保要求，便以（yǐ）不斷（duàn）擴（kuò）大產能的方式，以此求得行政（zhèng）部門對其下（xià）達環保達標的認定，此方（fāng）式也確實讓不少企業獲得（dé）了相關機構的審（shěn）批（pī）。
    然而，由於（yú）後續區劃（huá）的調整變化，當地政府會馬上撤回此類企業的已生效行政許（xǔ）可，該行（háng）為雖符（fú）合《國務院（yuàn）關於環境保護若幹問題的決定》等法律規定撤銷情形，但行政機關（guān）在該關停（tíng）通知上應當載明關停的法定理由和後續處（chù）理（lǐ）方案和相應的救濟渠道，如果隻是單純的責令關停、停建，沒有具體的解決方式（shì）和救濟途徑，那麽相關部門（mén）因撤銷原有（yǒu）行（háng）政行為所造成（chéng）的損害後果（guǒ），應承擔補償責任。行政機關雖未撤銷行政（zhèng）行為，但其以通知其他行政部門（mén）執（zhí）行（háng）其他（tā）行政行為的（de）方式，在事實上達到撤回企（qǐ）業許可效果的，也應予以補償。綜合上述情況（kuàng），環保達標、生產合規的表麵（miàn）處理企業可（kě）以根據具體情況，依法向當地政府申請補償。